Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700014D04RikJ3QMS2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms