Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem200cJ3QK46 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem200cJ3QK46 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms