Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Spdye4cI6XKQ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms