Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Arfip1G5E8V9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arfip1G5E8V9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms