Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
2610008E11RikG3X964 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610008E11RikG3X964 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms