Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rnf212F6TQD1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf212F6TQD1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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