Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BC067074F6RXI4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC067074F6RXI4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms