Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf165E9QAU8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf165E9QAU8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf165E9QAU8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf165E9QAU8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf165E9QAU8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf165E9QAU8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnf165E9QAU8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnf165E9QAU8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf165E9QAU8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnf165E9QAU8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnf165E9QAU8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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