Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cald1E9QA15 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cald1E9QA15 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms