Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp31E9Q6Y8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp31E9Q6Y8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms