Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BC051665E9Q623 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BC051665E9Q623 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms