Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17728E9Q5K2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms