Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20518E9Q548 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20518E9Q548 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms