Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NebE9Q1W3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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