Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pdzd2E9Q1M1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pdzd2E9Q1M1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzd2E9Q1M1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzd2E9Q1M1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzd2E9Q1M1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Pdzd2E9Q1M1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdzd2E9Q1M1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdzd2E9Q1M1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pdzd2E9Q1M1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pdzd2E9Q1M1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pdzd2E9Q1M1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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