Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N7

4930426L09Rik, RIKEN cDNA 4930426L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930426L09RikE9Q0N7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930426L09RikE9Q0N7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms