Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fndc1E9Q043 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fndc1E9Q043 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.8 ms