Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brd1E9PZ26 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Brd1E9PZ26 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms