Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rsph10bE9PYQ0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms