Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm5415E9PXF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5415E9PXF3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms