Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rsf1E9PWW9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rsf1E9PWW9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms