Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3002E9PW72 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3002E9PW72 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms