Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Clca3bE9PUL3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Clca3bE9PUL3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms