Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cngb1E1AZ71 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cngb1E1AZ71 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms