Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930455H04RikD3Z622 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930455H04RikD3Z622 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms