Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SafbD3YXK2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SafbD3YXK2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms