Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Kpna7C0LLJ0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms