Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptprz1B9EKR1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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