Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmf1B9EKI3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmf1B9EKI3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms