Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cttnbp2B9EJA2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cttnbp2B9EJA2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms