Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20547B8JJN0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm20547B8JJN0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm20547B8JJN0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm20547B8JJN0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm20547B8JJN0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm20547B8JJN0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20547B8JJN0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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