Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Phf11bB4XVQ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Phf11bB4XVQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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