Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cspp1B2RX88 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cspp1B2RX88 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms