Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ankrd34aB2RW11 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ankrd34aB2RW11 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms