Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc22a28B2RT89 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms