Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rrn3B2RS91 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrn3B2RS91 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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