Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ythdc2B2RR83 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ythdc2B2RR83 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms