Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trabd2bB1ATG9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trabd2bB1ATG9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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