Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp8b5A3FIN4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
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