Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rtf1A2AQ19 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rtf1A2AQ19 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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