Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Syndig1A2ANU3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syndig1A2ANU3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms