Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lcn6A2AJB9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lcn6A2AJB9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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