Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc183A2AJB1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc183A2AJB1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms