Protein–RNA interactions for Protein: A2AED3

Fndc7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc7A2AED3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fndc7A2AED3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms