Protein–RNA interactions for Protein: A2A3U9

Gm6268, Predicted gene 6268, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6268A2A3U9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm6268A2A3U9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm6268A2A3U9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms