Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc173A0JLY1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc173A0JLY1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms