Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv19A0A0B4J1H4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv19A0A0B4J1H4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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