Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H0

Trbv12-1, T cell receptor beta, variable 12-1 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trbv12-1A0A0B4J1H0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv12-1A0A0B4J1H0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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