Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms