Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gpbp1l1Q6NZP2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gpbp1l1Q6NZP2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms