Protein–RNA interactions for Protein: Q61206

Pafah1b2, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b2Q61206 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pafah1b2Q61206 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pafah1b2Q61206 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pafah1b2Q61206 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pafah1b2Q61206 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pafah1b2Q61206 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pafah1b2Q61206 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pafah1b2Q61206 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pafah1b2Q61206 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pafah1b2Q61206 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms